La Parroquia de Lençóis se menciona en el documento de donación de los terrenos a Nuestra Señora de la Piedad, el 28 de abril de 1858, lo que nos asegura que ya existía en esa fecha y, presumiblemente, que había una capilla dedicada a Nuestra Señora de la Piedad, siendo así la primera iglesia parroquial de la ciudad. La iglesia parroquial, tal como la conocemos hoy, se inauguró en 1953.

En 2000, la iglesia Matriz da Piedade fue declarada Santuario Jubilar por Dom Antônio Maria Mucciolo, entonces Arzobispo de Botucatu, convirtiéndose en destino de peregrinos de toda la región y recibiendo la designación de Santuario Arquidiocesano de Nuestra Señora de Piedade.

La Iglesia Matriz, ahora convertida en Santuario, fue sometida a tres importantes renovaciones, la última de las cuales tuvo lugar en 2015, con simbolismo, investigación y un gran esfuerzo. El antiguo suelo de ladrillo se sustituyó por granito/cuarzo. Las paredes recibieron el mismo material, con detalles de mármol y paneles blancos y amarillos, que simbolizan una joya. En la parte trasera de la iglesia, se creó un retablo con la imagen de Nuestra Señora de Aparecida y siete rayos amarillos detrás. En el centro de la iglesia se encuentra una reinterpretación del escudo de armas del Papa Juan Pablo II, con la M de María. El techo, pintado de azul, recibió una cubierta en forma de estrella para dar profundidad al cielo y simbolizar el manto de Nuestra Señora de Aparecida. Los tonos de la pintura exterior evocan los orígenes de la iglesia. Se conservaron los vitrales del Santuario, donados por familias de Lençóis Paulista y que realzan aún más la belleza del edificio.

El Santuario también alberga una imagen de la Piedad esculpida en madera por un artista italiano, pinturas de la artista lençois paulista Ivone Paccola que representan los dolores de María, y una réplica de la Cátedra que utilizó el Papa Benedicto XVI cuando vino a Brasil para la canonización de Fray Galvão, construida por estudiantes de la Unidad SENAI de Lençois paulista. Recientemente, el Santuario fue sometido a renovaciones internas y externas, preservando su estructura original y belleza arquitectónica. Su jardín alberga esculturas, entre ellas una imagen de un ángel que indica el camino de los dolores de Nuestra Señora y otras siete que representan los Siete Dolores de la Madre de la Misericordia.